Η εργασία αυτού του επιστήμονα του FDA βοηθά τους αξιωματούχους δημόσιας υγείας να βρίσκουν πιο γρήγορα πηγές μολυσμένων τροφίμων

Η καλύτερη εμπειρία ακρόασης είναι στο Chrome, τον Firefox ή το Safari. Εγγραφείτε στις καθημερινές ηχητικές συνεντεύξεις του Federal Drive στο Apple Podcasts ή PodcastOne.

Όταν οι άνθρωποι παθαίνουν κάποιο είδος τροφιμογενούς ασθένειας, θέλετε η πηγή να βγει από την αγορά το συντομότερο δυνατό. Κάποτε που χρειάστηκε εβδομάδες ή και μήνες. Steven Musser, αναπληρωτής διευθυντής Επιστημονικών Επιχειρήσεων στο Κέντρο Ασφάλειας Τροφίμων και Εφαρμοσμένης Διατροφής του FDA, ανέπτυξε την εφαρμογή μιας μεθοδολογίας που ονομάζεται γονιδιωματική επιδημιολογία. Στα τροφιμογενή heebie jeebies, επιταχύνει σημαντικά τον εντοπισμό της πηγής. Για τη δουλειά του, είναι φιναλίστ στο φετινό πρόγραμμα Service to America Medals και εντάχθηκε στο Federal Drive με τον Tom Temin να μιλήσουμε περισσότερο.

Τομ Τέμιν: Δρ Μουσέρ Χαίρομαι που σε έχουμε μαζί μας.

Steven Musser: Ευχαριστώ, Tom, ευχαριστώ για την ευκαιρία να μιλήσουμε για αυτό.

Τομ Τέμιν: Και ο COVID τα τελευταία χρόνια έχει κάπως εξαφανίσει οτιδήποτε άλλο από τη συνείδηση ​​του κοινού. Αλλά η τροφιμογενής ασθένεια είναι αρκετά άσχημη. Δώστε μας μια αίσθηση του πόσο διαδεδομένη είναι ακόμα και ποιες μπορεί να είναι μερικές από τις επιπτώσεις.

Steven Musser: Θα σας δώσω μόνο μερικές εκτιμήσεις από το CDC: Υπολογίζουν ότι περίπου 48 εκατομμύρια, σχεδόν 58 εκατομμύρια άνθρωποι στις Ηνωμένες Πολιτείες παθαίνουν τροφιμογενείς ασθένειες κάθε χρόνο. Περίπου 128.000 νοσηλεύονται και 3.000 πεθαίνουν. Αυτές είναι εκτιμήσεις, φυσικά. Μπορεί επίσης να είναι χρήσιμο να το θέσουμε με οικονομικούς όρους: Η οικονομική επιβάρυνση των τροφιμογενών ασθενειών είναι περίπου 18 δισεκατομμύρια δολάρια ετησίως.

Τομ Τέμιν: Άρα είναι κακό πρόβλημα με τον ένα ή τον άλλο τρόπο. Και θέλω να φτάσω κατευθείαν στη δουλειά σας, που είναι η γονιδιωματική επιδημιολογία. Τι είναι αυτό;

Steven Musser: Λοιπόν, αν φανταστείτε την τεχνολογία που χρησιμοποιείται αν έχετε ακούσει ποτέ για κρατούμενους που απελευθερώθηκαν με βάση το DNA τους, επειδή κατηγορήθηκαν ακατάλληλα ή τα στοιχεία ήταν ότι έχουν εμφανιστεί νέα στοιχεία με βάση γονιδιωματικές πληροφορίες, είναι ο ίδιος τύπος προσέγγιση εκτός από το ότι εξετάζουμε το δακτυλικό αποτύπωμα του DNA των βακτηρίων αντί για το βακτήριο ενός ανθρώπου. Και τα ταιριάζουμε. Και μπορούμε να πούμε, ναι, το ίδιο βρίσκεται σε ένα τρόφιμο που βρίσκεται σε κάποιον που αρρώστησε. Άρα βασικά έχουμε μια πολύ συγκεκριμένη και ευαίσθητη μέθοδος για την αναζήτηση και σύγκριση από τι αρρώστησαν οι άνθρωποι και πώς αρρώστησαν και πού συνδέεται, κάτι που είναι νέο και δεν είχαμε πριν. Στο παρελθόν, βασικά είχαμε μια προσέγγιση που φαινόταν σε άτομα που αρρώστησαν και ήταν χαμηλής ανάλυσης. Έτσι ξέραμε ότι οι άνθρωποι αρρώστησαν, αλλά δεν ξέραμε πώς αρρώστησαν ή από πού αρρώστησαν. Ήταν μια καλή τεχνολογία εκείνη την εποχή. Αλλά αυτό είναι πολύ καλύτερο σύστημα.Είναι πολύ πιο ευαίσθητο και πολύ πιο εύκολο t o σύνδεση της ασθένειας με την ανθρώπινη ασθένεια.

Τομ Τέμιν: Και μια ερώτηση λεπτομέρειας εδώ, κάποιος είναι άρρωστος και φαίνεται να έχει τα συμπτώματα αυτού που καταλαβαίνουμε ότι είναι τροφιμογενές. Πώς λαμβάνετε τα δείγματα βακτηρίων που μπορεί να είναι σχετικά και είναι σε αυτό το άτομο;

Steven Musser: Πολύ καλή ερώτηση. Επομένως, συνεργαζόμαστε με το CDC και άλλους ομοσπονδιακούς εταίρους. Το CDC κάνει την κλινική ασθένεια, χρηματοδοτεί τη δημόσια υγεία σε όλη τη χώρα σε κάθε πολιτεία και σε πολλές από τις μεγάλες πόλεις. Και αν κάποιος αρρωστήσει με μια αναφερόμενη ασθένεια όπως η σαλμονέλα, ή E. coli, το δημόσιο σύστημα υγείας εκεί θα το παραλάβει από το άτομο, ο γιατρός θα του δώσει καλλιέργεια, θα απομονώσει τα βακτήρια. Θα το ακολουθήσει και θα το ανεβάσει στην κεντρική βάση δεδομένων, που βρίσκεται στο NIH στο NCBI. Και μετά εμείς και το FSIS κάνουμε κάτι πολύ παρόμοιο. Το FSIS κάνει το μέρος του κρέατος και των πουλερικών. Κάνουμε επιτήρηση, συλλέγουμε δείγματα από εισαγωγές κατά τη διάρκεια επιθεωρήσεων. Χιλιάδες χιλιάδες κάθε χρόνο και απομονώνουμε τα βακτήρια από αυτά τα δείγματα και ανεβάστε τα στην ίδια βάση δεδομένων. Και έτσι, όπως λειτουργεί, έχουμε μερικούς πολύ εξελιγμένους αλγόριθμους υπολογιστών που εξετάζουν αυτά τα δεδομένα. Και κάθε μέρα μας λένε αν έχουμε ή δεν έχουμε αντιστοιχίσεις, ταιριάζουν καλά με την έννοια ότι σχετίζονται με το καθένα Και αυτό πραγματικά μας βοηθά να εντοπίσουμε την ασθένεια με τρόπους που δεν μπορούσαμε να το κάνουμε αλλιώς πριν.

Τομ Τέμιν: Και μόνο μια πιο λεπτομερής ερώτηση. Γνωρίζουμε ότι τώρα ότι η τροφιμογενής ασθένεια προέρχεται από μια ποικιλία τύπων τροφίμων. Το ίδιο είναι και το προφίλ βακτηρίων που μπορεί να είναι στο κοτόπουλο μοναδικό για το κοτόπουλο σε σύγκριση με αυτό που μπορεί να είναι στα γογγύλια, το οποίο είναι διαφορετικό από αυτό μπορεί να είναι στη ρόκα, για παράδειγμα;

Steven Musser: Παραδόξως όχι. Έτσι, αν είχατε σαλμονέλα, έχουμε κάνει μια τεράστια μελέτη για να απαντήσουμε σε αυτήν την ερώτηση στην ανατολική ακτή του Maryland, στη χερσόνησο Delmarva. Και εξετάσαμε ότι υπήρχε ένας πολύ διάσημος τύπος σαλμονέλας εκεί. Και είχε ένα συγκεκριμένο μοτίβο από το CDC κάθε χρόνο, αρρώστησε τους ανθρώπους. Και κοιτάξαμε πού μπορούσαμε να το βρούμε και το βρήκαμε στα κοτόπουλα, το βρήκαμε στο νερό, το βρήκαμε στα προϊόντα. Άρα είναι ακριβώς το ίδιο. Εξαρτάται μόνο από είτε είστε προσεκτικοί με την επεξεργασία του κοτόπουλου είτε είστε προσεκτικοί με το νερό που χρησιμοποιείτε όταν ποτίζετε καλλιέργειες, είτε όταν συγκομίζετε τις καλλιέργειες είστε προσεκτικοί με τον τρόπο που τα μαζεύετε, τα συσκευάζετε και τα στέλνετε Έτσι μπορείτε να έχετε τα ίδια βακτήρια απλά –

Τομ Τέμιν: Σίγουρα. Μιλάμε με τον Δρ. Steven Musser, που είναι αναπληρωτής διευθυντής για επιστημονικές λειτουργίες στο FDA Center for Food Safety and Applied Nutrition και φιναλίστ στο φετινό πρόγραμμα Service to America Medals. Και γνωρίζοντας αυτά τα προφίλ και ότι μπορεί να ταιριάξει Πώς μεταφράζεται αυτό λειτουργικά, ώστε οι τοπικές αρχές που εντοπίζουν αυτό το πράγμα στη συμμετοχή του CDC, ώστε τα τρόφιμα που μπορεί να έχουν μολυνθεί να εντοπιστούν και να αποσυρθούν γρήγορα από την αγορά;

Steven Musser: Ακούγεται εύκολο, αλλά είναι αρκετά περίπλοκο. Υπάρχουν δύο τρόποι για να το κάνετε αυτό. Για παράδειγμα, ας υποθέσουμε ότι κάναμε μια επιθεώρηση ενός φυτού. Και δεν υπήρχαν ασθένειες που να σχετίζονται με κανένα από τα προϊόντα, αλλά βρήκαμε ένα παθογόνο εκτός του φυτού ή όχι σε μια επιφάνεια επαφής με τρόφιμα, το ταξινομούσαμε και το ανεβάζαμε. Και κάποια στιγμή αργότερα, ας πούμε ότι υπάρχουν κάποιες κακές συνθήκες στο εργοστάσιο που μπορεί να σχετίζονται με τον καιρό, απλώς αλλαγή διαχείρισης, οτιδήποτε, και αρχίζουμε να βλέπουμε ασθένειες. στο παρελθόν, δεν μπορούσαμε να επέμβουμε. Τώρα μπορούμε να επέμβουμε αμέσως. Ξέρουμε ακριβώς επειδή η ευαισθησία και η ιδιαιτερότητα είναι τόσο καλή, ξέρουμε ακριβώς πού να κοιτάξουμε. Και μπορούμε να επιστρέψουμε σε αυτό το σχέδιο και να δούμε αν έχουν πρόβλημα, και αφήστε το προϊόν πολύ γρήγορα.

Αυτό λέγεται αναδρομική. Αυτό που συμβαίνει τις περισσότερες φορές, και αυτό είναι ότι αρχίζουμε να βλέπουμε ασθένειες. Το CDC αρχίζει να βλέπει τους ίδιους ανθρώπους να αρρωσταίνουν ακριβώς από τον ίδιο γενετικό οργανισμό, και αρχίζουν να βλέπουν καλά, ήταν από ένα φαγητό Είναι από κάτι που μπορεί να είχαν αρρωστήσει. Και αυτό ήταν, πολύ περίπλοκο. θα μπορούσες να έχεις 50 υλικά εκεί μέσα. Και ρώτησες κάποιον, είχες σαλάτα; Και σου λένε, ναι. Και τι είχε η σαλάτα; Μπορεί να θυμούνται ντομάτες ή μαρούλι.

Αλλά με τις γενετικές πληροφορίες, τώρα μπορούμε να πούμε και να βοηθήσουμε αυτές τις επιδημιολογικές έρευνες και να πούμε, μάλλον, είναι από το νοτιοανατολικό τμήμα των Ηνωμένων Πολιτειών, ή το νοτιοδυτικό, ή μοιάζει με κάτι που εισάγαμε από τη Νοτιοανατολική Ασία. Ή έχουμε το είδαμε πριν στην Ισπανία από εισαγωγές. Και έτσι μπορούμε να πάρουμε αυτά τα μείγματα μαρουλιού των 50 συστατικών και να τα αναλύσουμε γρήγορα και να πούμε ποιο είναι πιο πιθανό αυτό το συστατικό, ή πιθανότατα, από αυτήν την περιοχή, που επιταχύνει τον τρόπο με τον οποίο κάνουμε έρευνες. Και αν κοιτάξτε τα τελευταία 10 χρόνια, από τότε που εφαρμόσαμε τον ιχνηλάτη γονιδιώματος, αυτό που βλέπουμε είναι ότι ανιχνεύουμε περισσότερα κρούσματα, επειδή έχουμε μεγαλύτερη ευαισθησία, αλλά και παρεμβαίνουμε πιο γρήγορα. Έτσι, αντί να αρρωσταίνουν 700.000-800.000 άνθρωποι, έχουμε λιγότερα, 10, 20, 30. Επομένως, δεν επηρεάσαμε τόσο τον αριθμό των κρουσμάτων, αλλά τον αριθμό των ανθρώπων που αρρωσταίνουν από αυτό, χρησιμοποιώντας αυτήν την τεχνολογία

Τομ Τέμιν: Με την πάροδο του χρόνου, όσο περισσότερο μπαίνεις στη βάση δεδομένων παρακολούθησης γονιδιώματος των βακτηρίων, τόσο καλύτερα θα λειτουργεί το σύστημα. Φαίνεται ότι αυτοβελτιώνεται σε συνεχή βάση.

Steven Musser: Ναι, αυτό ήταν ένα από τα πράγματα που μας προσέλκυσαν σε αυτό. Είναι αρκετά ενδιαφέρον ότι το ψάχναμε από τα μέσα της δεκαετίας του 2000, είχαμε μια σειρά από σημαντικά ξεσπάσματα. Και προσπαθούσαμε να βρούμε έναν τρόπο να μπούμε πιο γρήγορα σε αυτό Και δοκιμάσαμε πολλές, πολλές, δεκάδες διαφορετικές προσεγγίσεις. Και όταν φτάσαμε σε αυτήν, θυμάμαι ότι κοιτούσα τα δεδομένα και πήγαινα, Ω, μου, αυτό θα δουλέψει. Και αυτό θα λειτουργήσει για πολύ καιρό χρόνο γιατί δεν χρειάζεται να το επαναλάβετε. Δεν χρειάζεται να αναπτύξετε μια νέα βάση δεδομένων, μπορείτε να προσθέσετε σε αυτήν την ίδια, κάτι που διορθώνεται από μόνο του, καθώς αν λάβετε κάτι μια σειρά που είναι λάθος, εμφανίζεται αυτόματα. Η τεχνολογία ήταν εξαιρετικά εύκολη στη χρήση. Έχουμε, έχουμε εκπαιδευτεί και στις 50 πολιτείες, καθώς και σε ορισμένες άλλες πολιτείες, διεθνείς κυβερνήσεις, και σε όλες τις περιπτώσεις, συνήθως μέσα σε μια εβδομάδα από τη λήψη των οργάνων και της εκπαίδευσης, οι άνθρωποι ανεβάζουν ακολουθίες στη βάση δεδομένων χωρίς κανένα πρόβλημα.Έτσι ήταν ένα αξιοσημείωτο ταξίδι και ό τσακίζοντας το μεγαλώνει.

Τομ Τέμιν: Και αυτό ήταν πραγματικά ένα μακροπρόθεσμο ταξίδι. Μπορώ να θυμηθώ το σκάνδαλο με τα βακτήρια Vichyssoise, νομίζω ότι ήταν στα τέλη της δεκαετίας του 1960. Και οι άνθρωποι άρχισαν να αντιλαμβάνονται αυτή τη σούπα από κονσέρβα πατάτας που δεν τη ζεστάσατε και ήταν δηλητηριώδης άνθρωποι. Δεν ξέρω πόσο καιρό ήταν πριν. Αλλά για λίγο, ποιο είναι το υπόβαθρό σας; Πώς καταλήξατε σε αυτό το είδος εργασίας και καταλήξατε στο FDA;

Steven Musser: Κάπως μέσα από μια μακρά κυκλική διαδρομή. Ήμουν εδώ, θα γιορτάσω την 31η επέτειό μου ως υπάλληλος της FDA αυτόν τον Αύγουστο. Ήρθα εδώ ήμουν μεταδιδακτορικός στο NIH. Το υπόβαθρό μου είναι η ιατρική χημεία. Φτιάχνω και συνθέτω νέα φάρμακα και να τα αξιολογήσω, ιδιαίτερα η ειδικότητά μου ήταν στην έρευνα για τον καρκίνο. Με προσέλαβαν η FDA για να κάνω αναλυτική χημεία και να δουλέψω σε διάφορα τρόφιμα. Σκέφτηκα ότι θα μείνω για λίγο και θα έφευγα και θα κοίταζα έναν κατασκευαστή φαρμάκων και εγώ Μου άρεσε πολύ. Η δουλειά ήταν πολύ ενδιαφέρουσα. Πάντα κάτι συνέβαινε. Και τα τρόφιμα ενδιαφέρονται πραγματικά για το φαγητό τους και την ποιότητα του φαγητού τους. Και έτσι ξεκίνησα ως χημικός πάγκου και 31 χρόνια αργότερα, κατέληξα ως αναπληρωτής διευθυντής κέντρου. Βρίσκομαι σε αυτή τη θέση για περίπου επτά χρόνια και πρέπει να εξετάσω όλα τα πράγματα για την ασφάλεια, όχι μόνο τα βακτήρια, αλλά και τους ιούς, τα χημικά, τα καλλυντικά, τα θέματα πριν από την αγορά, απλά μια ολόκληρη σειρά πραγμάτων. Και μου αρέσει. Είναι απλώς μια υπέροχη δουλειά να έχεις.

Τομ Τέμιν: Και πλησιάζετε ποτέ πια σε έναν καυστήρα Bunsen και σε μια φιάλη;

Steven Musser: Λοιπόν, νομίζω ότι οι περισσότεροι από τους εργαστηριακούς τώρα προσέχουν πολύ όταν κάνω εργαστηριακές επισκέψεις να μην με αφήσουν να αγγίξω τίποτα. Άσε με να το κρατήσω για σένα, άσε με να το πάρω για σένα – μην το αγγίζεις αυτό! Οπότε όχι, δεν προλαβαίνω, μπορώ να το κοιτάξω αλλά δεν προλαβαίνω να το αγγίζω πια.

Τομ Τέμιν: Ο Δρ. Steven Musser είναι αναπληρωτής διευθυντής για τις επιστημονικές λειτουργίες στο FDA Center for Food Safety and Applied Nutrition.

Steven Musser: Ευχαριστώ, Τομ.

Leave a Comment